Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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