Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdr1E9Q0B4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdr1E9Q0B4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdr1E9Q0B4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdr1E9Q0B4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdr1E9Q0B4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms