Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gcom1E9PZ54 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gcom1E9PZ54 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms