Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsph10bE9PYQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms