Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc62E9PVD1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc62E9PVD1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms