Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifit3bE9PV48 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms