Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm3252E9PUT9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3252E9PUT9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms