Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clca3bE9PUL3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3bE9PUL3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms