Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Soga1E1U8D0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Soga1E1U8D0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Soga1E1U8D0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms