Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930455H04RikD3Z622 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930455H04RikD3Z622 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms