Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc6D3YZP9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc6D3YZP9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms