Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm42791D3YYB5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm42791D3YYB5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms