Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc170D3YXL0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc170D3YXL0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms