Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samd1D3YXK1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms