Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rexo5D3YW29 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo5D3YW29 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms