Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm4950D3YUM8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm4950D3YUM8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm4950D3YUM8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4950D3YUM8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm4950D3YUM8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4950D3YUM8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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