Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmf1B9EKI3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms