Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mterf1bB9EJ57 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mterf1bB9EJ57 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms