Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf11bB4XVQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Phf11bB4XVQ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms