Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc11B2RXC1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms