Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp26c1B2RXA7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cyp26c1B2RXA7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cyp26c1B2RXA7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms