Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspp1B2RX88 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspp1B2RX88 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms