Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Siah3B2RWG3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Siah3B2RWG3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms