Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms