Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Brpf3B2KF05 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms