Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms