Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phactr2B1AVP0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phactr2B1AVP0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms