Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scml2B1AVB3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms