Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpruB1AUH1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtpruB1AUH1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtpruB1AUH1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms