Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Spocd1B1ASB6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spocd1B1ASB6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms