Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Grik3B1AS29 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms