Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp36B1AQJ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms