Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Supt3B0QZW4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms