Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp8b5A3FIN4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Atp8b5A3FIN4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Atp8b5A3FIN4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Atp8b5A3FIN4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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