Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf39A2RT81 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf39A2RT81 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf39A2RT81 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms