Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef25A2ASI9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramef25A2ASI9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms