Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtf1A2AQ19 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtf1A2AQ19 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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