Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtcflA2APF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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