Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm11A2AGX3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm11A2AGX3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms