Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5938A2AEN9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm5938A2AEN9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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Gm5938A2AEN9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm5938A2AEN9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm5938A2AEN9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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