Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms