Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myom3A2ABU4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myom3A2ABU4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Myom3A2ABU4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Myom3A2ABU4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Myom3A2ABU4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Myom3A2ABU4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Myom3A2ABU4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms