Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prdm16A2A935 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prdm16A2A935 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms