Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prdm2A2A7B5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Prdm2A2A7B5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms