Protein–RNA interactions for Protein: A0PJN4

Ube2ql1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2Q-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2ql1A0PJN4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2ql1A0PJN4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2ql1A0PJN4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2ql1A0PJN4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2ql1A0PJN4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2ql1A0PJN4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms