Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trav12-2A0N8N6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms