Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms