Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv16A0A0B4J1H3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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