Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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