Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ighv3-4A0A0A6YXF1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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